Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN4Q9UHM6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN4Q9UHM6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPN4Q9UHM6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms