Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM8A1Q9UBU6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM8A1Q9UBU6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM8A1Q9UBU6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
FAM8A1Q9UBU6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM8A1Q9UBU6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM8A1Q9UBU6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM8A1Q9UBU6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM8A1Q9UBU6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM8A1Q9UBU6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM8A1Q9UBU6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM8A1Q9UBU6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM8A1Q9UBU6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM8A1Q9UBU6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM8A1Q9UBU6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM8A1Q9UBU6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM8A1Q9UBU6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM8A1Q9UBU6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM8A1Q9UBU6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM8A1Q9UBU6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM8A1Q9UBU6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM8A1Q9UBU6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM8A1Q9UBU6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms