Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms