Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF38Q9NXL2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF38Q9NXL2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF38Q9NXL2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARHGEF38Q9NXL2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF38Q9NXL2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF38Q9NXL2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF38Q9NXL2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF38Q9NXL2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF38Q9NXL2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF38Q9NXL2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF38Q9NXL2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF38Q9NXL2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF38Q9NXL2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF38Q9NXL2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF38Q9NXL2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF38Q9NXL2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF38Q9NXL2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF38Q9NXL2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF38Q9NXL2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF38Q9NXL2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF38Q9NXL2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF38Q9NXL2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF38Q9NXL2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGEF38Q9NXL2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF38Q9NXL2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF38Q9NXL2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF38Q9NXL2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF38Q9NXL2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF38Q9NXL2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF38Q9NXL2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF38Q9NXL2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF38Q9NXL2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF38Q9NXL2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGEF38Q9NXL2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGEF38Q9NXL2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGEF38Q9NXL2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGEF38Q9NXL2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGEF38Q9NXL2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ARHGEF38Q9NXL2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARHGEF38Q9NXL2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF38Q9NXL2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF38Q9NXL2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms