Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK0

KLC4, Kinesin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC4Q9NSK0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLC4Q9NSK0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLC4Q9NSK0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLC4Q9NSK0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLC4Q9NSK0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLC4Q9NSK0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLC4Q9NSK0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLC4Q9NSK0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLC4Q9NSK0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLC4Q9NSK0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLC4Q9NSK0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLC4Q9NSK0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLC4Q9NSK0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLC4Q9NSK0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLC4Q9NSK0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLC4Q9NSK0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLC4Q9NSK0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLC4Q9NSK0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLC4Q9NSK0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLC4Q9NSK0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLC4Q9NSK0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLC4Q9NSK0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLC4Q9NSK0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLC4Q9NSK0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLC4Q9NSK0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLC4Q9NSK0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLC4Q9NSK0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms