Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL1Q9NR64 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL1Q9NR64 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL1Q9NR64 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL1Q9NR64 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms