Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZCCHC17Q9NP64 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZCCHC17Q9NP64 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZCCHC17Q9NP64 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZCCHC17Q9NP64 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZCCHC17Q9NP64 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZCCHC17Q9NP64 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZCCHC17Q9NP64 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZCCHC17Q9NP64 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZCCHC17Q9NP64 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZCCHC17Q9NP64 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZCCHC17Q9NP64 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZCCHC17Q9NP64 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZCCHC17Q9NP64 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZCCHC17Q9NP64 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZCCHC17Q9NP64 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZCCHC17Q9NP64 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZCCHC17Q9NP64 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZCCHC17Q9NP64 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZCCHC17Q9NP64 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
ZCCHC17Q9NP64 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZCCHC17Q9NP64 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
ZCCHC17Q9NP64 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZCCHC17Q9NP64 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZCCHC17Q9NP64 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZCCHC17Q9NP64 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZCCHC17Q9NP64 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZCCHC17Q9NP64 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZCCHC17Q9NP64 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZCCHC17Q9NP64 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZCCHC17Q9NP64 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZCCHC17Q9NP64 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZCCHC17Q9NP64 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZCCHC17Q9NP64 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ZCCHC17Q9NP64 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZCCHC17Q9NP64 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZCCHC17Q9NP64 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZCCHC17Q9NP64 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZCCHC17Q9NP64 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZCCHC17Q9NP64 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZCCHC17Q9NP64 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZCCHC17Q9NP64 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZCCHC17Q9NP64 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZCCHC17Q9NP64 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZCCHC17Q9NP64 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms