Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUDS3Q9H7L9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUDS3Q9H7L9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SUDS3Q9H7L9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUDS3Q9H7L9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUDS3Q9H7L9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUDS3Q9H7L9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUDS3Q9H7L9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUDS3Q9H7L9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUDS3Q9H7L9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUDS3Q9H7L9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUDS3Q9H7L9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SUDS3Q9H7L9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUDS3Q9H7L9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUDS3Q9H7L9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUDS3Q9H7L9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUDS3Q9H7L9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms