Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEMA6BQ9H3T3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SEMA6BQ9H3T3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEMA6BQ9H3T3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEMA6BQ9H3T3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms