Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYM8

RBCK1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBCK1Q9BYM8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBCK1Q9BYM8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBCK1Q9BYM8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBCK1Q9BYM8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms