Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIMD2Q9BT23 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMD2Q9BT23 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMD2Q9BT23 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMD2Q9BT23 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMD2Q9BT23 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMD2Q9BT23 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMD2Q9BT23 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMD2Q9BT23 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMD2Q9BT23 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIMD2Q9BT23 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LIMD2Q9BT23 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIMD2Q9BT23 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LIMD2Q9BT23 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIMD2Q9BT23 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIMD2Q9BT23 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIMD2Q9BT23 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LIMD2Q9BT23 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LIMD2Q9BT23 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LIMD2Q9BT23 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 355 ms