Protein–RNA interactions for Protein: Q99853

FOXB1, Forkhead box protein B1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXB1Q99853 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXB1Q99853 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXB1Q99853 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXB1Q99853 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXB1Q99853 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXB1Q99853 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXB1Q99853 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXB1Q99853 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXB1Q99853 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXB1Q99853 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXB1Q99853 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXB1Q99853 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXB1Q99853 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXB1Q99853 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXB1Q99853 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXB1Q99853 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXB1Q99853 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXB1Q99853 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXB1Q99853 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXB1Q99853 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXB1Q99853 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXB1Q99853 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXB1Q99853 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXB1Q99853 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXB1Q99853 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXB1Q99853 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXB1Q99853 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXB1Q99853 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXB1Q99853 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXB1Q99853 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXB1Q99853 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms