Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM8Q96KF7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM8Q96KF7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM8Q96KF7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM8Q96KF7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM8Q96KF7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM8Q96KF7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM8Q96KF7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM8Q96KF7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM8Q96KF7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM8Q96KF7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM8Q96KF7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM8Q96KF7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM8Q96KF7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM8Q96KF7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM8Q96KF7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM8Q96KF7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM8Q96KF7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM8Q96KF7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM8Q96KF7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM8Q96KF7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM8Q96KF7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM8Q96KF7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM8Q96KF7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM8Q96KF7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM8Q96KF7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM8Q96KF7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM8Q96KF7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMIM8Q96KF7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM8Q96KF7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM8Q96KF7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM8Q96KF7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM8Q96KF7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM8Q96KF7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM8Q96KF7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM8Q96KF7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMIM8Q96KF7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMIM8Q96KF7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SMIM8Q96KF7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMIM8Q96KF7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms