Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC16BQ96JE7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC16BQ96JE7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC16BQ96JE7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC16BQ96JE7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC16BQ96JE7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC16BQ96JE7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC16BQ96JE7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC16BQ96JE7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC16BQ96JE7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC16BQ96JE7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC16BQ96JE7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC16BQ96JE7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC16BQ96JE7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC16BQ96JE7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC16BQ96JE7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC16BQ96JE7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC16BQ96JE7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC16BQ96JE7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SEC16BQ96JE7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC16BQ96JE7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC16BQ96JE7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC16BQ96JE7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC16BQ96JE7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC16BQ96JE7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC16BQ96JE7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC16BQ96JE7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC16BQ96JE7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC16BQ96JE7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC16BQ96JE7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC16BQ96JE7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC16BQ96JE7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC16BQ96JE7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC16BQ96JE7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC16BQ96JE7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC16BQ96JE7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC16BQ96JE7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC16BQ96JE7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC16BQ96JE7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms