Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VTI1AQ96AJ9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VTI1AQ96AJ9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VTI1AQ96AJ9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
VTI1AQ96AJ9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VTI1AQ96AJ9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VTI1AQ96AJ9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VTI1AQ96AJ9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VTI1AQ96AJ9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VTI1AQ96AJ9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VTI1AQ96AJ9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VTI1AQ96AJ9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VTI1AQ96AJ9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VTI1AQ96AJ9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VTI1AQ96AJ9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VTI1AQ96AJ9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VTI1AQ96AJ9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VTI1AQ96AJ9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VTI1AQ96AJ9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VTI1AQ96AJ9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VTI1AQ96AJ9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
VTI1AQ96AJ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VTI1AQ96AJ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VTI1AQ96AJ9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VTI1AQ96AJ9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VTI1AQ96AJ9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VTI1AQ96AJ9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VTI1AQ96AJ9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VTI1AQ96AJ9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VTI1AQ96AJ9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VTI1AQ96AJ9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VTI1AQ96AJ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VTI1AQ96AJ9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VTI1AQ96AJ9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VTI1AQ96AJ9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VTI1AQ96AJ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VTI1AQ96AJ9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VTI1AQ96AJ9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VTI1AQ96AJ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VTI1AQ96AJ9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VTI1AQ96AJ9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VTI1AQ96AJ9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VTI1AQ96AJ9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VTI1AQ96AJ9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VTI1AQ96AJ9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VTI1AQ96AJ9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
VTI1AQ96AJ9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VTI1AQ96AJ9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VTI1AQ96AJ9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VTI1AQ96AJ9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
VTI1AQ96AJ9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VTI1AQ96AJ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VTI1AQ96AJ9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VTI1AQ96AJ9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VTI1AQ96AJ9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247 ms