Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX4Q969G2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX4Q969G2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX4Q969G2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX4Q969G2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX4Q969G2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX4Q969G2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX4Q969G2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX4Q969G2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX4Q969G2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX4Q969G2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX4Q969G2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX4Q969G2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX4Q969G2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX4Q969G2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX4Q969G2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX4Q969G2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX4Q969G2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX4Q969G2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX4Q969G2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX4Q969G2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX4Q969G2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms