Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDAQ92838 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EDAQ92838 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDAQ92838 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDAQ92838 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDAQ92838 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDAQ92838 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDAQ92838 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDAQ92838 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDAQ92838 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDAQ92838 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDAQ92838 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDAQ92838 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
EDAQ92838 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDAQ92838 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDAQ92838 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDAQ92838 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EDAQ92838 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EDAQ92838 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDAQ92838 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDAQ92838 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDAQ92838 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDAQ92838 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDAQ92838 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDAQ92838 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDAQ92838 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDAQ92838 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDAQ92838 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EDAQ92838 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EDAQ92838 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDAQ92838 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDAQ92838 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EDAQ92838 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDAQ92838 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDAQ92838 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDAQ92838 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDAQ92838 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDAQ92838 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDAQ92838 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
EDAQ92838 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDAQ92838 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDAQ92838 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDAQ92838 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDAQ92838 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDAQ92838 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDAQ92838 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EDAQ92838 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDAQ92838 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDAQ92838 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EDAQ92838 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDAQ92838 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDAQ92838 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
EDAQ92838 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDAQ92838 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDAQ92838 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDAQ92838 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDAQ92838 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDAQ92838 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDAQ92838 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDAQ92838 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDAQ92838 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDAQ92838 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDAQ92838 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EDAQ92838 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDAQ92838 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDAQ92838 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDAQ92838 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDAQ92838 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDAQ92838 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDAQ92838 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDAQ92838 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDAQ92838 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDAQ92838 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EDAQ92838 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDAQ92838 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDAQ92838 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDAQ92838 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
EDAQ92838 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDAQ92838 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDAQ92838 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDAQ92838 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDAQ92838 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EDAQ92838 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EDAQ92838 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EDAQ92838 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDAQ92838 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EDAQ92838 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDAQ92838 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDAQ92838 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDAQ92838 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDAQ92838 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDAQ92838 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDAQ92838 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDAQ92838 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDAQ92838 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDAQ92838 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDAQ92838 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDAQ92838 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EDAQ92838 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDAQ92838 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms