Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBG9

SYNPR, Synaptoporin, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPRQ8TBG9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPRQ8TBG9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPRQ8TBG9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPRQ8TBG9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPRQ8TBG9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPRQ8TBG9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNPRQ8TBG9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNPRQ8TBG9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPRQ8TBG9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPRQ8TBG9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYNPRQ8TBG9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNPRQ8TBG9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms