Protein–RNA interactions for Protein: Q86UV7

TRIM73, Tripartite motif-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM73Q86UV7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM73Q86UV7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM73Q86UV7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM73Q86UV7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM73Q86UV7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM73Q86UV7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM73Q86UV7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM73Q86UV7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM73Q86UV7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM73Q86UV7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM73Q86UV7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM73Q86UV7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM73Q86UV7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM73Q86UV7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM73Q86UV7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM73Q86UV7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM73Q86UV7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM73Q86UV7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM73Q86UV7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM73Q86UV7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM73Q86UV7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM73Q86UV7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM73Q86UV7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM73Q86UV7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM73Q86UV7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM73Q86UV7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM73Q86UV7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM73Q86UV7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM73Q86UV7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM73Q86UV7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM73Q86UV7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM73Q86UV7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM73Q86UV7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM73Q86UV7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM73Q86UV7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM73Q86UV7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM73Q86UV7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms