Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf33Q6P1S2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf33Q6P1S2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf33Q6P1S2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf33Q6P1S2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C3orf33Q6P1S2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf33Q6P1S2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf33Q6P1S2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf33Q6P1S2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf33Q6P1S2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf33Q6P1S2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf33Q6P1S2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf33Q6P1S2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf33Q6P1S2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf33Q6P1S2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf33Q6P1S2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf33Q6P1S2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C3orf33Q6P1S2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C3orf33Q6P1S2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf33Q6P1S2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf33Q6P1S2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms