Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF6Q5VXH4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF6Q5VXH4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF6Q5VXH4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF6Q5VXH4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF6Q5VXH4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF6Q5VXH4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF6Q5VXH4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF6Q5VXH4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF6Q5VXH4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF6Q5VXH4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF6Q5VXH4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF6Q5VXH4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF6Q5VXH4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF6Q5VXH4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF6Q5VXH4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF6Q5VXH4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF6Q5VXH4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF6Q5VXH4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF6Q5VXH4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF6Q5VXH4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF6Q5VXH4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF6Q5VXH4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF6Q5VXH4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF6Q5VXH4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF6Q5VXH4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF6Q5VXH4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF6Q5VXH4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms