Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0L3

SPATA46, Spermatogenesis-associated protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA46Q5T0L3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA46Q5T0L3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA46Q5T0L3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA46Q5T0L3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA46Q5T0L3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA46Q5T0L3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA46Q5T0L3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA46Q5T0L3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA46Q5T0L3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA46Q5T0L3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA46Q5T0L3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA46Q5T0L3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA46Q5T0L3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA46Q5T0L3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA46Q5T0L3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA46Q5T0L3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPATA46Q5T0L3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA46Q5T0L3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA46Q5T0L3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms