Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC25A52Q3SY17 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC25A52Q3SY17 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC25A52Q3SY17 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC25A52Q3SY17 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC25A52Q3SY17 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC25A52Q3SY17 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC25A52Q3SY17 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC25A52Q3SY17 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC25A52Q3SY17 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC25A52Q3SY17 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC25A52Q3SY17 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC25A52Q3SY17 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC25A52Q3SY17 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC25A52Q3SY17 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC25A52Q3SY17 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
SLC25A52Q3SY17 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC25A52Q3SY17 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC25A52Q3SY17 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC25A52Q3SY17 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC25A52Q3SY17 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC25A52Q3SY17 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC25A52Q3SY17 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC25A52Q3SY17 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC25A52Q3SY17 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC25A52Q3SY17 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC25A52Q3SY17 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC25A52Q3SY17 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC25A52Q3SY17 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC25A52Q3SY17 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC25A52Q3SY17 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC25A52Q3SY17 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC25A52Q3SY17 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC25A52Q3SY17 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC25A52Q3SY17 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC25A52Q3SY17 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC25A52Q3SY17 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC25A52Q3SY17 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC25A52Q3SY17 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC25A52Q3SY17 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC25A52Q3SY17 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC25A52Q3SY17 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC25A52Q3SY17 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC25A52Q3SY17 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC25A52Q3SY17 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC25A52Q3SY17 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC25A52Q3SY17 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC25A52Q3SY17 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC25A52Q3SY17 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms