Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP66

INAVA, Innate immunity activator protein, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INAVAQ3KP66 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
INAVAQ3KP66 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INAVAQ3KP66 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INAVAQ3KP66 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INAVAQ3KP66 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INAVAQ3KP66 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INAVAQ3KP66 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INAVAQ3KP66 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INAVAQ3KP66 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INAVAQ3KP66 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INAVAQ3KP66 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INAVAQ3KP66 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
INAVAQ3KP66 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
INAVAQ3KP66 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
INAVAQ3KP66 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
INAVAQ3KP66 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
INAVAQ3KP66 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
INAVAQ3KP66 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
INAVAQ3KP66 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
INAVAQ3KP66 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
INAVAQ3KP66 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
INAVAQ3KP66 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
INAVAQ3KP66 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INAVAQ3KP66 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INAVAQ3KP66 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INAVAQ3KP66 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
INAVAQ3KP66 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INAVAQ3KP66 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
INAVAQ3KP66 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
INAVAQ3KP66 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
INAVAQ3KP66 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
INAVAQ3KP66 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INAVAQ3KP66 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INAVAQ3KP66 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INAVAQ3KP66 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INAVAQ3KP66 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INAVAQ3KP66 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INAVAQ3KP66 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms