Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MRPL23Q16540 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL23Q16540 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL23Q16540 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL23Q16540 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms