Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF1Q15637 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF1Q15637 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF1Q15637 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF1Q15637 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF1Q15637 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SF1Q15637 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF1Q15637 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF1Q15637 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF1Q15637 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF1Q15637 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SF1Q15637 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF1Q15637 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF1Q15637 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF1Q15637 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF1Q15637 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF1Q15637 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF1Q15637 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF1Q15637 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF1Q15637 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF1Q15637 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF1Q15637 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF1Q15637 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SF1Q15637 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF1Q15637 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF1Q15637 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF1Q15637 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF1Q15637 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF1Q15637 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF1Q15637 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF1Q15637 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF1Q15637 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF1Q15637 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF1Q15637 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF1Q15637 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF1Q15637 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF1Q15637 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF1Q15637 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF1Q15637 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SF1Q15637 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF1Q15637 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF1Q15637 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF1Q15637 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF1Q15637 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF1Q15637 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF1Q15637 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF1Q15637 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF1Q15637 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF1Q15637 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF1Q15637 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SF1Q15637 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF1Q15637 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF1Q15637 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF1Q15637 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF1Q15637 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF1Q15637 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF1Q15637 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF1Q15637 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF1Q15637 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF1Q15637 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SF1Q15637 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SF1Q15637 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF1Q15637 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF1Q15637 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF1Q15637 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF1Q15637 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF1Q15637 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF1Q15637 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF1Q15637 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF1Q15637 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF1Q15637 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF1Q15637 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF1Q15637 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF1Q15637 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF1Q15637 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SF1Q15637 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF1Q15637 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF1Q15637 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF1Q15637 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF1Q15637 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF1Q15637 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF1Q15637 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF1Q15637 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF1Q15637 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF1Q15637 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF1Q15637 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF1Q15637 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF1Q15637 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF1Q15637 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SF1Q15637 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF1Q15637 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF1Q15637 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF1Q15637 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF1Q15637 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF1Q15637 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF1Q15637 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF1Q15637 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF1Q15637 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF1Q15637 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF1Q15637 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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