Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRRQ15256 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRRQ15256 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRRQ15256 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRRQ15256 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
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