Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRDNQ13061 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRDNQ13061 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRDNQ13061 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRDNQ13061 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRDNQ13061 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRDNQ13061 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TRDNQ13061 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRDNQ13061 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRDNQ13061 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRDNQ13061 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRDNQ13061 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRDNQ13061 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRDNQ13061 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRDNQ13061 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
TRDNQ13061 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRDNQ13061 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRDNQ13061 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TRDNQ13061 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
TRDNQ13061 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRDNQ13061 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRDNQ13061 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRDNQ13061 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRDNQ13061 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRDNQ13061 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
TRDNQ13061 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRDNQ13061 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRDNQ13061 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TRDNQ13061 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRDNQ13061 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRDNQ13061 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
TRDNQ13061 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRDNQ13061 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRDNQ13061 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TRDNQ13061 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
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