Protein–RNA interactions for Protein: Q08AM6

VAC14, Protein VAC14 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAC14Q08AM6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAC14Q08AM6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VAC14Q08AM6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAC14Q08AM6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAC14Q08AM6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VAC14Q08AM6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VAC14Q08AM6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAC14Q08AM6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAC14Q08AM6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAC14Q08AM6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAC14Q08AM6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAC14Q08AM6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAC14Q08AM6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAC14Q08AM6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAC14Q08AM6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAC14Q08AM6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAC14Q08AM6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAC14Q08AM6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAC14Q08AM6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAC14Q08AM6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAC14Q08AM6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAC14Q08AM6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAC14Q08AM6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAC14Q08AM6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAC14Q08AM6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAC14Q08AM6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAC14Q08AM6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAC14Q08AM6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAC14Q08AM6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAC14Q08AM6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAC14Q08AM6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAC14Q08AM6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAC14Q08AM6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAC14Q08AM6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAC14Q08AM6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAC14Q08AM6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms