Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF17Q02223 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF17Q02223 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF17Q02223 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF17Q02223 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF17Q02223 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF17Q02223 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF17Q02223 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF17Q02223 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF17Q02223 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF17Q02223 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF17Q02223 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF17Q02223 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF17Q02223 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF17Q02223 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF17Q02223 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF17Q02223 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF17Q02223 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF17Q02223 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF17Q02223 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF17Q02223 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF17Q02223 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF17Q02223 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF17Q02223 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF17Q02223 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFRSF17Q02223 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF17Q02223 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF17Q02223 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms