Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PITX1P78337 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PITX1P78337 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PITX1P78337 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PITX1P78337 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PITX1P78337 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PITX1P78337 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PITX1P78337 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PITX1P78337 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PITX1P78337 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PITX1P78337 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PITX1P78337 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PITX1P78337 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PITX1P78337 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PITX1P78337 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PITX1P78337 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PITX1P78337 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PITX1P78337 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PITX1P78337 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PITX1P78337 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PITX1P78337 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PITX1P78337 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PITX1P78337 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PITX1P78337 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PITX1P78337 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PITX1P78337 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PITX1P78337 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PITX1P78337 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PITX1P78337 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PITX1P78337 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PITX1P78337 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PITX1P78337 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PITX1P78337 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PITX1P78337 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PITX1P78337 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PITX1P78337 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PITX1P78337 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PITX1P78337 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PITX1P78337 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PITX1P78337 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PITX1P78337 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITX1P78337 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITX1P78337 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITX1P78337 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITX1P78337 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PITX1P78337 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PITX1P78337 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PITX1P78337 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PITX1P78337 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PITX1P78337 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITX1P78337 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITX1P78337 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITX1P78337 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITX1P78337 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITX1P78337 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PITX1P78337 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PITX1P78337 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PITX1P78337 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PITX1P78337 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PITX1P78337 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PITX1P78337 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PITX1P78337 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PITX1P78337 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PITX1P78337 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PITX1P78337 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PITX1P78337 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PITX1P78337 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PITX1P78337 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PITX1P78337 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PITX1P78337 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PITX1P78337 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PITX1P78337 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PITX1P78337 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PITX1P78337 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PITX1P78337 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PITX1P78337 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PITX1P78337 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PITX1P78337 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PITX1P78337 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PITX1P78337 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PITX1P78337 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PITX1P78337 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PITX1P78337 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PITX1P78337 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PITX1P78337 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PITX1P78337 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PITX1P78337 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PITX1P78337 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PITX1P78337 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PITX1P78337 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PITX1P78337 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PITX1P78337 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PITX1P78337 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PITX1P78337 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PITX1P78337 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PITX1P78337 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PITX1P78337 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PITX1P78337 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PITX1P78337 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PITX1P78337 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms