Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPD2P62316 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPD2P62316 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPD2P62316 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms