Protein–RNA interactions for Protein: P56470

LGALS4, Galectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS4P56470 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LGALS4P56470 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LGALS4P56470 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LGALS4P56470 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LGALS4P56470 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGALS4P56470 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LGALS4P56470 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LGALS4P56470 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LGALS4P56470 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LGALS4P56470 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LGALS4P56470 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LGALS4P56470 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms