Protein–RNA interactions for Protein: P56470

LGALS4, Galectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS4P56470 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LGALS4P56470 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LGALS4P56470 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LGALS4P56470 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LGALS4P56470 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LGALS4P56470 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LGALS4P56470 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LGALS4P56470 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LGALS4P56470 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LGALS4P56470 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LGALS4P56470 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LGALS4P56470 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LGALS4P56470 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LGALS4P56470 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LGALS4P56470 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LGALS4P56470 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LGALS4P56470 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LGALS4P56470 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LGALS4P56470 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGALS4P56470 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGALS4P56470 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGALS4P56470 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGALS4P56470 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LGALS4P56470 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LGALS4P56470 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LGALS4P56470 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LGALS4P56470 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGALS4P56470 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LGALS4P56470 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGALS4P56470 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGALS4P56470 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LGALS4P56470 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGALS4P56470 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGALS4P56470 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGALS4P56470 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGALS4P56470 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGALS4P56470 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGALS4P56470 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGALS4P56470 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGALS4P56470 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LGALS4P56470 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGALS4P56470 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGALS4P56470 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LGALS4P56470 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGALS4P56470 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGALS4P56470 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGALS4P56470 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGALS4P56470 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGALS4P56470 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LGALS4P56470 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LGALS4P56470 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGALS4P56470 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGALS4P56470 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGALS4P56470 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LGALS4P56470 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGALS4P56470 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGALS4P56470 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGALS4P56470 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGALS4P56470 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGALS4P56470 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGALS4P56470 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGALS4P56470 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGALS4P56470 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGALS4P56470 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGALS4P56470 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGALS4P56470 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LGALS4P56470 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGALS4P56470 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGALS4P56470 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGALS4P56470 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LGALS4P56470 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGALS4P56470 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGALS4P56470 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGALS4P56470 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGALS4P56470 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGALS4P56470 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGALS4P56470 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGALS4P56470 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGALS4P56470 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGALS4P56470 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGALS4P56470 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGALS4P56470 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGALS4P56470 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGALS4P56470 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGALS4P56470 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGALS4P56470 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGALS4P56470 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGALS4P56470 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGALS4P56470 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGALS4P56470 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGALS4P56470 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGALS4P56470 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGALS4P56470 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGALS4P56470 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGALS4P56470 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGALS4P56470 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGALS4P56470 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGALS4P56470 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGALS4P56470 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGALS4P56470 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms