Protein–RNA interactions for Protein: P56177

DLX1, Homeobox protein DLX-1, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLX1P56177 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DLX1P56177 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DLX1P56177 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DLX1P56177 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DLX1P56177 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DLX1P56177 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DLX1P56177 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLX1P56177 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLX1P56177 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLX1P56177 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLX1P56177 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLX1P56177 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLX1P56177 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DLX1P56177 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DLX1P56177 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DLX1P56177 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DLX1P56177 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DLX1P56177 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DLX1P56177 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DLX1P56177 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DLX1P56177 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DLX1P56177 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DLX1P56177 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DLX1P56177 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DLX1P56177 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DLX1P56177 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DLX1P56177 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DLX1P56177 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DLX1P56177 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DLX1P56177 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DLX1P56177 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DLX1P56177 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DLX1P56177 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DLX1P56177 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DLX1P56177 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DLX1P56177 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DLX1P56177 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DLX1P56177 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DLX1P56177 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DLX1P56177 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DLX1P56177 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DLX1P56177 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DLX1P56177 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DLX1P56177 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DLX1P56177 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DLX1P56177 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DLX1P56177 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DLX1P56177 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DLX1P56177 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DLX1P56177 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DLX1P56177 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DLX1P56177 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DLX1P56177 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DLX1P56177 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLX1P56177 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLX1P56177 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DLX1P56177 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DLX1P56177 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DLX1P56177 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DLX1P56177 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DLX1P56177 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DLX1P56177 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DLX1P56177 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DLX1P56177 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DLX1P56177 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DLX1P56177 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DLX1P56177 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DLX1P56177 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DLX1P56177 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DLX1P56177 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DLX1P56177 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DLX1P56177 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLX1P56177 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLX1P56177 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLX1P56177 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLX1P56177 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DLX1P56177 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DLX1P56177 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DLX1P56177 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DLX1P56177 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DLX1P56177 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DLX1P56177 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DLX1P56177 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DLX1P56177 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DLX1P56177 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DLX1P56177 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DLX1P56177 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DLX1P56177 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DLX1P56177 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DLX1P56177 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DLX1P56177 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DLX1P56177 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DLX1P56177 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DLX1P56177 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DLX1P56177 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DLX1P56177 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DLX1P56177 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DLX1P56177 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DLX1P56177 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DLX1P56177 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms