Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
NESP48681 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
NESP48681 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
NESP48681 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
NESP48681 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC46.34■■■■■ 5.01
NESP48681 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
NESP48681 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
NESP48681 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC46.33■■■■■ 5.01
NESP48681 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC46.32■■■■■ 5
NESP48681 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
NESP48681 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
NESP48681 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
NESP48681 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC46.3■■■■■ 5
NESP48681 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
NESP48681 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
NESP48681 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
NESP48681 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC46.29■■■■■ 5
NESP48681 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
NESP48681 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
NESP48681 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
NESP48681 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
NESP48681 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
NESP48681 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC46.24■■■■■ 4.99
NESP48681 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
NESP48681 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC46.22■■■■■ 4.99
NESP48681 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
NESP48681 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC46.21■■■■■ 4.99
NESP48681 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC46.21■■■■■ 4.99
NESP48681 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.98
NESP48681 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
NESP48681 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.17■■■■■ 4.98
NESP48681 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC46.16■■■■■ 4.98
NESP48681 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.16■■■■■ 4.98
NESP48681 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
NESP48681 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
NESP48681 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
NESP48681 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
NESP48681 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
NESP48681 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC46.13■■■■■ 4.98
NESP48681 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC46.13■■■■■ 4.97
NESP48681 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC46.13■■■■■ 4.97
NESP48681 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC46.11■■■■■ 4.97
NESP48681 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC46.11■■■■■ 4.97
NESP48681 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC46.11■■■■■ 4.97
NESP48681 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
NESP48681 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC46.1■■■■■ 4.97
NESP48681 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC46.1■■■■■ 4.97
NESP48681 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
NESP48681 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
NESP48681 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
NESP48681 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
NESP48681 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
NESP48681 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
NESP48681 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC46.06■■■■■ 4.96
NESP48681 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
NESP48681 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC46.05■■■■■ 4.96
NESP48681 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC46.05■■■■■ 4.96
NESP48681 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC46.04■■■■■ 4.96
NESP48681 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.03■■■■■ 4.96
NESP48681 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC46.02■■■■■ 4.96
NESP48681 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
NESP48681 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
NESP48681 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.99■■■■■ 4.95
NESP48681 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
NESP48681 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC45.98■■■■■ 4.95
NESP48681 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
NESP48681 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC45.97■■■■■ 4.95
NESP48681 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
NESP48681 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC45.95■■■■■ 4.95
NESP48681 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
NESP48681 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
NESP48681 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
NESP48681 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
NESP48681 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC45.91■■■■■ 4.94
NESP48681 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
NESP48681 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
NESP48681 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC45.9■■■■■ 4.94
NESP48681 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC45.9■■■■■ 4.94
NESP48681 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
NESP48681 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
NESP48681 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC45.88■■■■■ 4.94
NESP48681 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.93
NESP48681 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC45.87■■■■■ 4.93
NESP48681 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
NESP48681 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC45.85■■■■■ 4.93
NESP48681 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
NESP48681 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
NESP48681 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.85■■■■■ 4.93
NESP48681 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC45.83■■■■■ 4.93
NESP48681 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC45.81■■■■■ 4.92
NESP48681 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.81■■■■■ 4.92
NESP48681 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
NESP48681 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
NESP48681 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC45.8■■■■■ 4.92
NESP48681 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC45.8■■■■■ 4.92
NESP48681 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.8■■■■■ 4.92
NESP48681 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
NESP48681 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
NESP48681 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
NESP48681 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms