Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SSFA2P28290 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SSFA2P28290 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SSFA2P28290 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SSFA2P28290 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SSFA2P28290 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SSFA2P28290 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SSFA2P28290 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SSFA2P28290 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SSFA2P28290 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SSFA2P28290 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
SSFA2P28290 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SSFA2P28290 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SSFA2P28290 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SSFA2P28290 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SSFA2P28290 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SSFA2P28290 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SSFA2P28290 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SSFA2P28290 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SSFA2P28290 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SSFA2P28290 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SSFA2P28290 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SSFA2P28290 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SSFA2P28290 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SSFA2P28290 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SSFA2P28290 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SSFA2P28290 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SSFA2P28290 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SSFA2P28290 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SSFA2P28290 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SSFA2P28290 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SSFA2P28290 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SSFA2P28290 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SSFA2P28290 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SSFA2P28290 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SSFA2P28290 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SSFA2P28290 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SSFA2P28290 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SSFA2P28290 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SSFA2P28290 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SSFA2P28290 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
SSFA2P28290 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SSFA2P28290 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SSFA2P28290 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SSFA2P28290 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SSFA2P28290 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SSFA2P28290 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
SSFA2P28290 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SSFA2P28290 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SSFA2P28290 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SSFA2P28290 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SSFA2P28290 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SSFA2P28290 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SSFA2P28290 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SSFA2P28290 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SSFA2P28290 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SSFA2P28290 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SSFA2P28290 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SSFA2P28290 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SSFA2P28290 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SSFA2P28290 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SSFA2P28290 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SSFA2P28290 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SSFA2P28290 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SSFA2P28290 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SSFA2P28290 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SSFA2P28290 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SSFA2P28290 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SSFA2P28290 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SSFA2P28290 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SSFA2P28290 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SSFA2P28290 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SSFA2P28290 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SSFA2P28290 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SSFA2P28290 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SSFA2P28290 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SSFA2P28290 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SSFA2P28290 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SSFA2P28290 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SSFA2P28290 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SSFA2P28290 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SSFA2P28290 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SSFA2P28290 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SSFA2P28290 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SSFA2P28290 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SSFA2P28290 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SSFA2P28290 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SSFA2P28290 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SSFA2P28290 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SSFA2P28290 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SSFA2P28290 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SSFA2P28290 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SSFA2P28290 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SSFA2P28290 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SSFA2P28290 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
SSFA2P28290 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SSFA2P28290 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SSFA2P28290 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SSFA2P28290 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SSFA2P28290 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms