Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APCP25054 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APCP25054 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APCP25054 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APCP25054 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APCP25054 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APCP25054 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APCP25054 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APCP25054 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APCP25054 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APCP25054 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APCP25054 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APCP25054 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APCP25054 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APCP25054 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APCP25054 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APCP25054 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APCP25054 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APCP25054 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APCP25054 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APCP25054 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APCP25054 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APCP25054 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APCP25054 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APCP25054 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APCP25054 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APCP25054 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APCP25054 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APCP25054 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APCP25054 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APCP25054 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APCP25054 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APCP25054 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APCP25054 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APCP25054 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APCP25054 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APCP25054 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APCP25054 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APCP25054 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APCP25054 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APCP25054 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APCP25054 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APCP25054 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APCP25054 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APCP25054 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APCP25054 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APCP25054 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APCP25054 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APCP25054 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APCP25054 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APCP25054 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APCP25054 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APCP25054 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APCP25054 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APCP25054 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APCP25054 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APCP25054 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APCP25054 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APCP25054 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APCP25054 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APCP25054 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APCP25054 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APCP25054 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APCP25054 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APCP25054 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APCP25054 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APCP25054 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APCP25054 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APCP25054 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APCP25054 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APCP25054 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APCP25054 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APCP25054 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APCP25054 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APCP25054 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APCP25054 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APCP25054 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APCP25054 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APCP25054 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APCP25054 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APCP25054 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APCP25054 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APCP25054 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APCP25054 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APCP25054 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APCP25054 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APCP25054 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APCP25054 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APCP25054 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APCP25054 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APCP25054 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APCP25054 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APCP25054 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APCP25054 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APCP25054 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APCP25054 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APCP25054 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APCP25054 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APCP25054 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APCP25054 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms