Protein–RNA interactions for Protein: P24310

COX7A1, Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX7A1P24310 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COX7A1P24310 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COX7A1P24310 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COX7A1P24310 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COX7A1P24310 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COX7A1P24310 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COX7A1P24310 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COX7A1P24310 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX7A1P24310 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COX7A1P24310 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COX7A1P24310 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX7A1P24310 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COX7A1P24310 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX7A1P24310 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX7A1P24310 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX7A1P24310 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COX7A1P24310 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX7A1P24310 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX7A1P24310 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX7A1P24310 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX7A1P24310 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX7A1P24310 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX7A1P24310 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms