Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LCP1P13796 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LCP1P13796 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LCP1P13796 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LCP1P13796 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LCP1P13796 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LCP1P13796 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LCP1P13796 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LCP1P13796 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LCP1P13796 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LCP1P13796 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LCP1P13796 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LCP1P13796 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LCP1P13796 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCP1P13796 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCP1P13796 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCP1P13796 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LCP1P13796 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LCP1P13796 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LCP1P13796 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LCP1P13796 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LCP1P13796 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LCP1P13796 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LCP1P13796 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LCP1P13796 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LCP1P13796 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LCP1P13796 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LCP1P13796 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCP1P13796 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCP1P13796 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCP1P13796 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCP1P13796 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCP1P13796 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCP1P13796 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCP1P13796 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCP1P13796 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCP1P13796 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LCP1P13796 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LCP1P13796 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LCP1P13796 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LCP1P13796 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LCP1P13796 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LCP1P13796 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LCP1P13796 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCP1P13796 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LCP1P13796 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCP1P13796 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCP1P13796 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCP1P13796 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCP1P13796 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCP1P13796 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LCP1P13796 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LCP1P13796 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LCP1P13796 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LCP1P13796 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LCP1P13796 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LCP1P13796 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LCP1P13796 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LCP1P13796 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LCP1P13796 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LCP1P13796 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LCP1P13796 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LCP1P13796 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LCP1P13796 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LCP1P13796 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LCP1P13796 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LCP1P13796 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LCP1P13796 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LCP1P13796 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LCP1P13796 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LCP1P13796 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LCP1P13796 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LCP1P13796 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LCP1P13796 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LCP1P13796 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LCP1P13796 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LCP1P13796 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LCP1P13796 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LCP1P13796 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LCP1P13796 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LCP1P13796 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LCP1P13796 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LCP1P13796 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LCP1P13796 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LCP1P13796 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LCP1P13796 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LCP1P13796 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LCP1P13796 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LCP1P13796 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LCP1P13796 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LCP1P13796 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LCP1P13796 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LCP1P13796 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LCP1P13796 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LCP1P13796 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LCP1P13796 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LCP1P13796 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCP1P13796 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCP1P13796 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCP1P13796 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms