Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HKR1P10072 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HKR1P10072 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HKR1P10072 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HKR1P10072 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HKR1P10072 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HKR1P10072 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HKR1P10072 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HKR1P10072 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HKR1P10072 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HKR1P10072 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HKR1P10072 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HKR1P10072 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HKR1P10072 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HKR1P10072 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HKR1P10072 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HKR1P10072 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HKR1P10072 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HKR1P10072 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HKR1P10072 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HKR1P10072 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HKR1P10072 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HKR1P10072 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HKR1P10072 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HKR1P10072 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HKR1P10072 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HKR1P10072 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HKR1P10072 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HKR1P10072 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HKR1P10072 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HKR1P10072 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HKR1P10072 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HKR1P10072 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HKR1P10072 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HKR1P10072 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HKR1P10072 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HKR1P10072 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HKR1P10072 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HKR1P10072 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HKR1P10072 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HKR1P10072 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HKR1P10072 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HKR1P10072 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HKR1P10072 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HKR1P10072 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HKR1P10072 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HKR1P10072 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HKR1P10072 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HKR1P10072 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HKR1P10072 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HKR1P10072 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HKR1P10072 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HKR1P10072 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HKR1P10072 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HKR1P10072 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HKR1P10072 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HKR1P10072 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HKR1P10072 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HKR1P10072 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HKR1P10072 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HKR1P10072 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HKR1P10072 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HKR1P10072 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HKR1P10072 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HKR1P10072 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HKR1P10072 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HKR1P10072 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HKR1P10072 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HKR1P10072 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HKR1P10072 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HKR1P10072 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HKR1P10072 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HKR1P10072 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HKR1P10072 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HKR1P10072 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HKR1P10072 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HKR1P10072 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HKR1P10072 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HKR1P10072 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HKR1P10072 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HKR1P10072 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HKR1P10072 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HKR1P10072 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HKR1P10072 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HKR1P10072 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HKR1P10072 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HKR1P10072 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HKR1P10072 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HKR1P10072 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HKR1P10072 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HKR1P10072 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HKR1P10072 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HKR1P10072 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HKR1P10072 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HKR1P10072 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HKR1P10072 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HKR1P10072 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HKR1P10072 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HKR1P10072 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HKR1P10072 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms