Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TPM2P07951 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TPM2P07951 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TPM2P07951 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TPM2P07951 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TPM2P07951 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TPM2P07951 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TPM2P07951 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TPM2P07951 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TPM2P07951 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TPM2P07951 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TPM2P07951 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TPM2P07951 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TPM2P07951 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TPM2P07951 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TPM2P07951 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TPM2P07951 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TPM2P07951 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TPM2P07951 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TPM2P07951 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TPM2P07951 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TPM2P07951 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TPM2P07951 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TPM2P07951 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TPM2P07951 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TPM2P07951 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TPM2P07951 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TPM2P07951 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TPM2P07951 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TPM2P07951 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TPM2P07951 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TPM2P07951 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TPM2P07951 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TPM2P07951 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TPM2P07951 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TPM2P07951 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TPM2P07951 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TPM2P07951 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TPM2P07951 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TPM2P07951 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TPM2P07951 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TPM2P07951 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TPM2P07951 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TPM2P07951 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TPM2P07951 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TPM2P07951 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TPM2P07951 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TPM2P07951 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TPM2P07951 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TPM2P07951 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TPM2P07951 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TPM2P07951 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TPM2P07951 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TPM2P07951 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TPM2P07951 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TPM2P07951 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TPM2P07951 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TPM2P07951 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TPM2P07951 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TPM2P07951 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TPM2P07951 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TPM2P07951 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TPM2P07951 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TPM2P07951 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TPM2P07951 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TPM2P07951 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TPM2P07951 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TPM2P07951 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TPM2P07951 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TPM2P07951 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TPM2P07951 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TPM2P07951 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TPM2P07951 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TPM2P07951 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TPM2P07951 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TPM2P07951 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TPM2P07951 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TPM2P07951 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TPM2P07951 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TPM2P07951 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TPM2P07951 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TPM2P07951 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TPM2P07951 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TPM2P07951 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TPM2P07951 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TPM2P07951 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TPM2P07951 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TPM2P07951 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TPM2P07951 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TPM2P07951 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TPM2P07951 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TPM2P07951 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TPM2P07951 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TPM2P07951 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TPM2P07951 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TPM2P07951 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TPM2P07951 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TPM2P07951 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TPM2P07951 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TPM2P07951 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms