Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGHV3-33P01772 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-33P01772 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-33P01772 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-33P01772 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-33P01772 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-33P01772 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-33P01772 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGHV3-33P01772 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-33P01772 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGHV3-33P01772 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms