Protein–RNA interactions for Protein: O96015

DNAL4, Dynein light chain 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL4O96015 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAL4O96015 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAL4O96015 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAL4O96015 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms