Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED1O96006 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZBED1O96006 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBED1O96006 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBED1O96006 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBED1O96006 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZBED1O96006 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZBED1O96006 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZBED1O96006 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED1O96006 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED1O96006 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED1O96006 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED1O96006 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBED1O96006 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBED1O96006 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBED1O96006 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBED1O96006 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBED1O96006 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBED1O96006 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBED1O96006 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZBED1O96006 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZBED1O96006 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED1O96006 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
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