Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
JRKO75564 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
JRKO75564 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JRKO75564 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
JRKO75564 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JRKO75564 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JRKO75564 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JRKO75564 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
JRKO75564 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
JRKO75564 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
JRKO75564 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
JRKO75564 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
JRKO75564 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
JRKO75564 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
JRKO75564 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
JRKO75564 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
JRKO75564 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
JRKO75564 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
JRKO75564 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
JRKO75564 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
JRKO75564 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
JRKO75564 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
JRKO75564 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
JRKO75564 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
JRKO75564 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
JRKO75564 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
JRKO75564 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
JRKO75564 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
JRKO75564 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JRKO75564 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JRKO75564 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JRKO75564 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JRKO75564 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JRKO75564 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JRKO75564 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
JRKO75564 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
JRKO75564 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JRKO75564 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
JRKO75564 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
JRKO75564 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
JRKO75564 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
JRKO75564 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
JRKO75564 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
JRKO75564 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
JRKO75564 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JRKO75564 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JRKO75564 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JRKO75564 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JRKO75564 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
JRKO75564 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
JRKO75564 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JRKO75564 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
JRKO75564 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
JRKO75564 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JRKO75564 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
JRKO75564 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
JRKO75564 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JRKO75564 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JRKO75564 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JRKO75564 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
JRKO75564 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
JRKO75564 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
JRKO75564 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
JRKO75564 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
JRKO75564 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
JRKO75564 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
JRKO75564 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
JRKO75564 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
JRKO75564 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
JRKO75564 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
JRKO75564 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
JRKO75564 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
JRKO75564 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
JRKO75564 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
JRKO75564 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
JRKO75564 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
JRKO75564 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
JRKO75564 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
JRKO75564 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
JRKO75564 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
JRKO75564 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
JRKO75564 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
JRKO75564 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
JRKO75564 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
JRKO75564 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
JRKO75564 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
JRKO75564 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
JRKO75564 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
JRKO75564 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
JRKO75564 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
JRKO75564 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
JRKO75564 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
JRKO75564 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
JRKO75564 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
JRKO75564 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
JRKO75564 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
JRKO75564 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
JRKO75564 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
JRKO75564 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
JRKO75564 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms