Protein–RNA interactions for Protein: O75074

LRP3, Low-density lipoprotein receptor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3O75074 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRP3O75074 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRP3O75074 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRP3O75074 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LRP3O75074 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRP3O75074 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRP3O75074 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRP3O75074 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRP3O75074 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRP3O75074 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRP3O75074 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRP3O75074 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRP3O75074 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRP3O75074 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRP3O75074 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRP3O75074 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRP3O75074 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRP3O75074 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRP3O75074 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRP3O75074 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRP3O75074 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRP3O75074 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRP3O75074 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRP3O75074 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRP3O75074 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRP3O75074 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRP3O75074 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRP3O75074 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRP3O75074 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRP3O75074 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRP3O75074 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRP3O75074 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LRP3O75074 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LRP3O75074 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRP3O75074 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRP3O75074 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRP3O75074 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRP3O75074 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRP3O75074 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRP3O75074 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRP3O75074 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRP3O75074 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRP3O75074 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRP3O75074 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRP3O75074 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRP3O75074 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRP3O75074 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRP3O75074 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRP3O75074 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRP3O75074 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRP3O75074 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRP3O75074 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRP3O75074 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRP3O75074 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP3O75074 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP3O75074 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP3O75074 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP3O75074 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP3O75074 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP3O75074 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP3O75074 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP3O75074 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP3O75074 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP3O75074 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP3O75074 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP3O75074 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP3O75074 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP3O75074 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP3O75074 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP3O75074 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP3O75074 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP3O75074 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP3O75074 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP3O75074 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP3O75074 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP3O75074 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP3O75074 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP3O75074 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP3O75074 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP3O75074 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP3O75074 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP3O75074 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP3O75074 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP3O75074 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP3O75074 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP3O75074 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP3O75074 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP3O75074 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRP3O75074 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRP3O75074 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRP3O75074 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRP3O75074 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRP3O75074 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRP3O75074 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRP3O75074 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRP3O75074 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRP3O75074 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRP3O75074 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRP3O75074 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRP3O75074 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1554.7 ms