Protein–RNA interactions for Protein: O60763

USO1, General vesicular transport factor p115, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USO1O60763 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USO1O60763 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USO1O60763 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USO1O60763 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USO1O60763 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USO1O60763 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USO1O60763 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USO1O60763 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USO1O60763 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USO1O60763 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USO1O60763 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USO1O60763 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USO1O60763 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USO1O60763 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USO1O60763 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USO1O60763 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USO1O60763 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
USO1O60763 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USO1O60763 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USO1O60763 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USO1O60763 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USO1O60763 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USO1O60763 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USO1O60763 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USO1O60763 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USO1O60763 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USO1O60763 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USO1O60763 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USO1O60763 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USO1O60763 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
USO1O60763 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USO1O60763 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USO1O60763 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USO1O60763 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USO1O60763 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USO1O60763 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USO1O60763 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USO1O60763 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USO1O60763 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USO1O60763 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USO1O60763 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USO1O60763 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USO1O60763 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USO1O60763 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
USO1O60763 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USO1O60763 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USO1O60763 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USO1O60763 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USO1O60763 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USO1O60763 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USO1O60763 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USO1O60763 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USO1O60763 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USO1O60763 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USO1O60763 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USO1O60763 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USO1O60763 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USO1O60763 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USO1O60763 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USO1O60763 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USO1O60763 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USO1O60763 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USO1O60763 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USO1O60763 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USO1O60763 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USO1O60763 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
USO1O60763 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USO1O60763 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USO1O60763 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USO1O60763 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
USO1O60763 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USO1O60763 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USO1O60763 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USO1O60763 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USO1O60763 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USO1O60763 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USO1O60763 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USO1O60763 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USO1O60763 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USO1O60763 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USO1O60763 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USO1O60763 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USO1O60763 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USO1O60763 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USO1O60763 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USO1O60763 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USO1O60763 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USO1O60763 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USO1O60763 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USO1O60763 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USO1O60763 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USO1O60763 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USO1O60763 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USO1O60763 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USO1O60763 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USO1O60763 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USO1O60763 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USO1O60763 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USO1O60763 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USO1O60763 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms