Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MARCH6O60337 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MARCH6O60337 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MARCH6O60337 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MARCH6O60337 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MARCH6O60337 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MARCH6O60337 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MARCH6O60337 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MARCH6O60337 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MARCH6O60337 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MARCH6O60337 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MARCH6O60337 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MARCH6O60337 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MARCH6O60337 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MARCH6O60337 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MARCH6O60337 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MARCH6O60337 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MARCH6O60337 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MARCH6O60337 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MARCH6O60337 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MARCH6O60337 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MARCH6O60337 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MARCH6O60337 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MARCH6O60337 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MARCH6O60337 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MARCH6O60337 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MARCH6O60337 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MARCH6O60337 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MARCH6O60337 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MARCH6O60337 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MARCH6O60337 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MARCH6O60337 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MARCH6O60337 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MARCH6O60337 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MARCH6O60337 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MARCH6O60337 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MARCH6O60337 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MARCH6O60337 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MARCH6O60337 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MARCH6O60337 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MARCH6O60337 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MARCH6O60337 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MARCH6O60337 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MARCH6O60337 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MARCH6O60337 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MARCH6O60337 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MARCH6O60337 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MARCH6O60337 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MARCH6O60337 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MARCH6O60337 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MARCH6O60337 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms