Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD9O15198 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD9O15198 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD9O15198 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD9O15198 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD9O15198 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMAD9O15198 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms